La facturation d’un kinésithérapeute libéral obéit à des règles techniques et réglementaires précises que les logiciels généralistes ne maîtrisent pas. Les feuilles de soins électroniques (FSE), la télétransmission CPAM via la carte Vitale, la gestion du tiers-payant et la cotation en NGAP/AMK forment un premier bloc. La comptabilité BNC avec la déclaration 2035 en constitue un second. Ce guide compare les solutions les mieux adaptées aux kinésithérapeutes libéraux pour simplifier leur facturation au quotidien.

Besoins spécifiques des kinésithérapeutes en facturation

La facturation d’un kiné libéral combine des contraintes métier et comptables qui s’articulent autour de deux flux distincts.

FSE et télétransmission CPAM. La feuille de soins électronique (FSE) est le document central de la facturation paramédicale. Le praticien la transmet directement à la CPAM via la carte Vitale du patient et son lecteur de carte. Ce flux nécessite un logiciel certifié SESAM-Vitale, distinct d’un simple outil de facturation comptable.

Cotation NGAP et code AMK. Chaque acte de masso-kinésithérapie est coté selon la Nomenclature Générale des Actes Professionnels (NGAP) avec un code AMK. Le logiciel métier intègre ces nomenclatures pour générer automatiquement les bons codes sur les feuilles de soins. Un logiciel comptable généraliste n’en dispose pas.

Tiers-payant et remboursements. Le tiers-payant permet au patient de ne payer que le ticket modérateur (ou rien en cas de dispense totale). Le cabinet encaisse directement les remboursements de la CPAM et des complémentaires. Le suivi de ces flux, parfois décalés de plusieurs semaines, doit être tracé dans le logiciel.

Comptabilité BNC et déclaration 2035. Sur le plan comptable, le kinésithérapeute libéral déclare ses revenus en BNC via la déclaration 2035. Les recettes enregistrées dans le logiciel métier alimentent ensuite la comptabilité pour les déclarations fiscales et sociales.

Meilleures solutions de facturation pour kinésithérapeute

5 logiciels sélectionnés pour les kinésithérapeutes libéraux, couvrant deux besoins distincts :

  • Logiciels métier certifiés SESAM-Vitale (télétransmission FSE, cotation NGAP)
  • Logiciels comptables BNC (déclaration 2035, rapprochement bancaire)
LogicielPoints fortsTarif indicatifIdéal pour
IndyBNC, déclaration 2035, cotisations URSSAF, synchronisation bancaireGratuit à 20 €/moisKiné souhaitant gérer sa comptabilité BNC sans comptable
PennylaneComptabilité collaborative, accès expert-comptable, tableau de bord clairA partir de 39 €/moisKiné avec expert-comptable partenaire Pennylane
L-Expert ComptableLogiciel + comptable dédié à distance, tout inclusA partir de 49 €/moisKiné souhaitant tout externaliser
DoctolibPrise de rendez-vous + télétransmission + feuilles de soinsSur devisKiné cherchant une solution métier tout-en-un
CegedimLogiciel métier paramédical certifié SESAM-Vitale, FSE, NGAPSur devisKiné voulant un logiciel métier complet pour les soins

Comment choisir votre logiciel de facturation en tant que kinésithérapeute

Si vous cherchez un outil pour la télétransmission et les feuilles de soins, Doctolib ou Cegedim sont les solutions métiers à examiner. Ils gèrent la cotation NGAP, les FSE et la télétransmission CPAM directement depuis leur interface. Ce sont des outils conçus pour le flux de soins, pas pour la comptabilité annuelle.

Si votre priorité est la comptabilité BNC et la déclaration 2035, Indy est la solution la plus adaptée aux kinésithérapeutes libéraux. Intuitive, elle couvre les recettes, le rapprochement bancaire, les cotisations URSSAF et la 2035. Elle ne remplace pas un logiciel SESAM-Vitale pour la télétransmission, mais elle gère parfaitement la comptabilité aval.

Si vous travaillez avec un expert-comptable, Pennylane simplifie la collaboration : votre comptable accède à votre espace en temps réel, les saisies sont partagées et la clôture annuelle se déroule sans friction. L’outil se synchronise avec votre compte bancaire professionnel.

Si vous souhaitez tout déléguer, L-Expert Comptable propose un service clés en main : vous transmettez vos relevés et justificatifs, un comptable dédié prend en charge les déclarations. Idéal pour les kinésithérapeutes qui veulent se concentrer sur leurs soins sans gérer la comptabilité.

Questions clés à poser avant de choisir :

  • Le logiciel gère-t-il la déclaration 2035 en BNC ?
  • Propose-t-il la télétransmission CPAM et la gestion FSE (si vous cherchez un outil métier) ?
  • Intègre-t-il la cotation NGAP/AMK ?
  • Le support connaît-il les spécificités des professions paramédicales ?
  • La synchronisation bancaire est-elle incluse dans le tarif de base ?

Pour approfondir votre choix, consultez notre guide des logiciels pour kinésithérapeutes, notre comparatif des logiciels de facturation et notre page dédiée à la comptabilité pour kinésithérapeutes.