Logiciel Facturation électronique 2026
Choisir un logiciel de facturation électronique est devenu une décision urgente pour toutes les entreprises françaises assujetties à la TVA. Dès le 1er septembre 2026, l’obligation de recevoir des factures structurées s’impose à toutes les structures, quelle que soit leur taille. Attendre n’est plus une option.
Ce guide compare les six logiciels les plus utilisés en France, explique les différences entre les profils et détaille ce que la réforme impose concrètement. Vous repartirez avec une recommandation claire pour votre situation, qu’il s’agisse d’un logiciel gratuit pour micro-entrepreneur ou d’une suite complète pour PME.
Pourquoi choisir un logiciel de facturation électronique en 2026 ?
La réforme de la facturation électronique est le changement réglementaire le plus structurant pour les entreprises françaises depuis plusieurs années. Elle repose sur la loi de finances rectificative 2022 (n°2022-1157) et concerne toutes les entreprises établies en France et assujetties à la TVA.
Un outil non conforme bloque votre activité dès septembre 2026. Un PDF par e-mail ou une facture exportée depuis un tableur ne passent plus pour les échanges B2B. Chaque facture doit transiter par une Plateforme Agréée (PA) immatriculée par la DGFiP, dans un format structuré — Factur-X, UBL ou CII.
La réforme vise trois objectifs : lutter contre la fraude à la TVA, simplifier les déclarations fiscales par pré-remplissage, et améliorer la connaissance en temps réel de l’activité économique. Pour l’entreprise, le bénéfice direct est une charge administrative réduite et une meilleure traçabilité des paiements.
Le calendrier officiel et les obligations détaillées se trouvent sur économie.gouv.fr — tout savoir sur la facturation électronique.
E-invoicing et e-reporting : deux obligations à distinguer
La réforme impose deux obligations distinctes que les logiciels doivent gérer :
L’e-invoicing concerne les échanges de factures B2B entre entreprises françaises assujetties à la TVA. Chaque facture structurée doit transiter via une Plateforme Agréée dans un format lisible par machine (Factur-X, UBL ou CII).
L’e-reporting s’applique aux ventes aux particuliers (B2C) et aux transactions avec des clients étrangers. Il ne s’agit pas de transmettre la facture entière, mais des données de transaction et de paiement à l’administration fiscale via une Plateforme Agréée.
Un bon logiciel de facturation électronique gère les deux flux. Vérifiez explicitement que votre outil couvre le e-reporting si vous avez des clients particuliers ou étrangers.
Comparatif des meilleurs logiciels de facturation électronique
Six outils se démarquent en 2026 pour leur conformité à la réforme et leur adéquation aux différents profils d’entreprise. Notre sélection suit la grille d’évaluation décrite dans notre méthodologie de classement.
Pennylane
Pennylane est l’un des rares éditeurs à avoir obtenu le statut de Plateforme Agréée (PA) directement auprès de la DGFiP. Cela signifie qu’aucun tiers n’est nécessaire pour router vos factures électroniques : tout passe par Pennylane. Pour les entreprises qui travaillent avec un expert-comptable, l’accès collaboratif en temps réel est un atout décisif.
Avantages clés : PA agréée DGFiP native, e-invoicing et e-reporting sans module externe, synchronisation bancaire, espace expert-comptable en temps réel.
Limites : prix plus élevé que les outils simples, interface comptable qui demande une prise en main.
Tarifs 2026 : à partir de 14 € HT/mois (indépendants), 49 € HT/mois (entreprises).
À retenir pour : PME, startups, professions libérales avec un expert-comptable actif.
Tiime
Tiime est immatriculé Plateforme Agréée par la DGFiP, avec hébergement sur serveurs français. Sa version gratuite inclut l’émission de factures conformes, les relances automatiques et la réception de factures électroniques — les deux obligations couvertes dès le premier niveau. Plus de 200 000 indépendants utilisent l’outil, avec une note de 4,8/5 sur la base des avis collectés.
Avantages clés : PA agréée DGFiP, hébergement France, gratuit pour l’essentiel, prise en main rapide.
Limites : comptabilité et notes de frais en option payante, pas adapté aux structures multi-utilisateurs.
Tarifs 2026 : gratuit pour les fonctionnalités de base, plans payants modulables.
À retenir pour : micro-entrepreneurs, auto-entrepreneurs, freelances débutants.
Sellsy
Sellsy est une suite tout-en-un : CRM, devis, facturation électronique, trésorerie et paiements en ligne dans un seul outil. L’éditeur est préenregistré Plateforme Agréée DGFiP.
Points forts : CRM intégré et PA agréée DGFiP, relances automatisées, connexion bancaire, tableau de bord unifié.
Points faibles : coût plus élevé pour les structures qui n’utilisent que la partie facturation, courbe d’apprentissage pour maîtriser toutes les fonctionnalités.
Tarifs 2026 : à partir de 29 € HT/mois (offre Solo).
À retenir pour : TPE et PME avec un cycle de vente structuré, agences, consultants ayant besoin du CRM.
Solutions pour indépendants et petites structures
Indy
Indy cible les indépendants en BNC, les professions libérales et les micro-entrepreneurs qui veulent une comptabilité de trésorerie simple. La version gratuite couvre la déclaration URSSAF, le suivi du chiffre d’affaires et la génération de factures. Les plans avancés intègrent la conformité facturation électronique et la liasse fiscale.
Avantages clés : plan gratuit sans durée limitée, synchronisation bancaire, déclarations automatisées, plus de 250 000 utilisateurs actifs.
Limites : conformité PA à confirmer selon le plan souscrit, inadapté aux SARL/SAS avec des besoins avancés.
Tarifs 2026 : plan gratuit disponible, plans avancés dès 12 € HT/mois.
À retenir pour : auto-entrepreneurs, indépendants en BNC, professions libérales.
Cegid
Cegid est un éditeur français historique pour les PME et ETI, PA agréée DGFiP. Suite au rachat d’EBP, les clients existants bénéficient d’une continuité de service. L’offre couvre la comptabilité, la gestion commerciale et la facturation électronique avec des modules évolutifs.
Points forts : PA agréée DGFiP, couverture fonctionnelle étendue (comptabilité, ERP, paie), réseau dense de partenaires experts-comptables, conformité e-invoicing et e-reporting.
Points faibles : tarif plus élevé que les solutions orientées TPE, interface moins intuitive que les outils nés en SaaS.
Tarifs 2026 : à partir de 20 € HT/mois pour les offres TPE.
À retenir pour : PME structurées, ETI, cabinets comptables gérant plusieurs sociétés.
Henrri
Henrri est un logiciel français gratuit, développé par le groupe Rivalis. Il couvre la facturation, les devis et le suivi des encaissements — sans abonnement ni publicité.
Points forts : 100 % gratuit sans fonctionnalités limitées, sans publicité, développé par un groupe spécialisé dans l’accompagnement des entrepreneurs, interface simple et directe.
Points faibles : moins d’intégrations que les solutions premium, fonctionnalités comptables plus limitées, statut PA à confirmer selon la version utilisée.
Tarifs 2026 : gratuit.
À retenir pour : micro-entrepreneurs et indépendants cherchant une solution gratuite fiable.
Quel logiciel selon votre profil ?
Le bon outil dépend de votre structure, de votre volume d’activité et de vos obligations réglementaires.
Micro-entrepreneur et auto-entrepreneur
Votre obligation d’émettre des factures électroniques ne démarre qu’au 1er septembre 2027. En revanche, vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques dès le 1er septembre 2026 si vous êtes assujetti à la TVA. Même exonéré de TVA à la base, mieux vaut anticiper.
Votre priorité : un outil gratuit, simple à prendre en main, déjà conforme ou en voie de l’être.
Recommandation : Tiime (gratuit, PA agréée) ou Henrri (gratuit, sans limitation). Indy est également une option solide si vous avez des besoins de déclarations fiscales intégrées.
Indépendant, freelance et profession libérale
Vous êtes en comptabilité de trésorerie. Vos priorités : générer des factures conformes, gérer les encaissements, préparer les déclarations URSSAF et fiscales, et travailler éventuellement avec un expert-comptable.
Recommandation : Indy (plan payant, meilleur rapport fonctionnalités/prix pour les BNC) ou Pennylane (si vous avez un expert-comptable et souhaitez une collaboration en temps réel). Si vous avez aussi un besoin de gestion commerciale, Sellsy offre une valeur ajoutée.
TPE et petite PME
Vous êtes en comptabilité d’engagement, soumis à la TVA, et vous travaillez avec un cabinet comptable. L’obligation d’émission vous concerne à partir de septembre 2026 si vous êtes ETI, ou à partir de septembre 2027 pour les PME.
Vos priorités : conformité PA intégrée, synchronisation bancaire, accès expert-comptable, gestion des notes de frais.
Recommandation : Pennylane (meilleure intégration expert-comptable et conformité PA) ou Sellsy (si le CRM est un besoin central).
PME et ETI
Pour les structures de plus grande taille, la conformité PA est non négociable dès septembre 2026 pour l’émission. Les besoins incluent la comptabilité analytique, la gestion multi-utilisateurs et la connexion avec les systèmes existants (ERP, banque pro).
Recommandation : Pennylane Premium, Sellsy ou Cegid, selon la complexité de votre organisation et votre réseau de partenaires.
Les critères essentiels pour bien choisir
Avant toute décision, vérifiez ces quatre points.
Statut de Plateforme Agréée (PA)
C’est le critère n°1. Un logiciel non-PA agréée ne peut pas gérer la réforme. Depuis le 1er septembre 2026, toutes les factures B2B doivent transiter via une PA immatriculée par la DGFiP.
La liste officielle des PA est publiée sur impots.gouv.fr.
Vérifiez si votre outil est lui-même PA agréée ou s’il se connecte à une PA tierce. Les deux approches sont valides, mais la première simplifie la gestion. La conformité réglementaire dépend directement de ce statut — demandez-le par écrit à l’éditeur.
Formats de factures supportés
Trois formats sont reconnus : Factur-X (PDF + XML, référence PME), UBL 2.1 (XML pur, grandes entreprises et EDI) et CII (XML pur, échanges complexes internationaux). Tous respectent la norme EN 16931.
Les PA assurent la conversion automatique entre formats. En pratique, Factur-X reste le choix le plus accessible pour les TPE et PME : il conserve le rendu PDF habituel tout en intégrant les données structurées.
Intégration comptable et bancaire
Un bon logiciel de facturation électronique doit synchroniser vos données avec votre comptabilité et votre banque. La synchronisation bancaire automatise le rapprochement des écritures. L’accès expert-comptable en temps réel évite les exports manuels et les échanges par e-mail.
Vérifiez aussi la couverture du e-reporting si vous avez des ventes B2C ou des clients hors France.
Coût total réel
Le tarif affiché ne reflète pas toujours le coût total. Certains éditeurs facturent séparément la PA agréée, la télédéclaration TVA, les sauvegardes ou le support avancé. Pour une TPE, comptez 15 à 50 €/mois tout compris. Pour une PME, 50 à 150 €/mois, auxquels peuvent s’ajouter 1 000 à 2 500 € de mise en route.
Les solutions gratuites (Tiime, Henrri, Indy plan gratuit) couvrent les besoins des structures simples sans engagement financier.
Consultez notre page comment nous nous finançons et notre transparence pour comprendre notre modèle éditorial indépendant.
Calendrier de la réforme : ce qui change en 2026 et 2027
Le calendrier de la réforme est progressif, avec deux obligations distinctes : la réception et l’émission de factures électroniques.
Dès le 1er septembre 2026 :
- Toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques structurées.
- Les grandes entreprises et ETI doivent également émettre leurs factures en format électronique via une PA.
Dès le 1er septembre 2027 :
- Les PME, TPE et micro-entreprises ont l’obligation d’émettre leurs factures en format électronique.
Plus de 10 millions d’acteurs économiques entrent dans le champ de la réforme. Retrouvez les détails officiels sur Service-public Entreprendre — facturation électronique obligatoire.
Les nouvelles mentions obligatoires dès septembre 2026
Quatre nouvelles mentions s’ajoutent aux obligations habituelles :
- Le SIREN du client : clé de routage dans l’annuaire géré par l’AIFE et la DGFiP.
- L’adresse de livraison si différente de l’adresse de facturation.
- La nature de l’opération : livraison de biens, prestation de services, ou mixte.
- La mention “TVA sur les débits” le cas échéant.
Une erreur de SIREN ou une mention manquante entraîne une amende forfaitaire de 15 € par mention, plafonnée à 25 % du montant total de la facture.
Un bon logiciel de facturation électronique vérifie automatiquement la présence et le format de ces mentions avant l’envoi. C’est l’un des critères de choix les plus concrets à évaluer lors d’un essai.
FAQ — logiciel de facturation électronique
Quel logiciel de facturation électronique gratuit en 2026 ?
Tiime et Henrri proposent les meilleures offres gratuites en 2026. Tiime est immatriculé Plateforme Agréée DGFiP avec hébergement en France. Henrri, développé par le groupe Rivalis, offre une version complète sans publicité ni limitations. Indy dispose aussi d’un plan gratuit pour les fonctionnalités de base.
Pour les structures plus complexes, la gratuité a ses limites. Vérifiez que le plan choisi couvre bien la conformité e-invoicing et e-reporting selon votre situation avant de vous engager.
La facturation électronique est-elle obligatoire pour les auto-entrepreneurs ?
Oui, avec deux dates clés. Dès le 1er septembre 2026, vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques si vous êtes assujetti à la TVA. L’obligation d’émettre ne démarre pour les micro-entreprises qu’en septembre 2027. Les auto-entrepreneurs exonérés de TVA restent hors du champ de l’e-invoicing, mais se préparer en avance reste une bonne pratique.
Qu’est-ce qu’une Plateforme Agréée (PA) ?
Une Plateforme Agréée (PA) est un opérateur privé immatriculé par la DGFiP pour gérer les flux d’e-invoicing et d’e-reporting. Plus de 130 PA figurent au registre DGFiP en 2026, chacune avec ses propres fonctionnalités et tarifs. Chaque entreprise choisit librement sa PA. La liste complète se consulte sur impots.gouv.fr.
Quelle est la différence entre e-invoicing et e-reporting ?
L’e-invoicing désigne l’échange de factures structurées entre entreprises françaises via une PA. L’e-reporting concerne la transmission de données de transaction à l’administration — pour les ventes B2C et les clients étrangers. Différence clé : en e-invoicing, la facture entière circule. En e-reporting, seules les données de transaction partent vers l’administration, sans facture complète.
Quels formats de facture électronique sont acceptés en France ?
Trois formats sont autorisés : Factur-X (PDF + XML, adapté aux PME), UBL 2.1 (XML pur, grandes entreprises et EDI) et CII (XML pur, échanges complexes). Tous respectent la norme EN 16931. Les PA assurent la conversion automatique : votre logiciel et celui de votre client peuvent utiliser des formats différents.
Ce guide a été produit par l’équipe Appvize, selon notre méthodologie de classement indépendante.